Artykuły przysłane do Redakcji „Studiów Mazowieckich” są poddawane wstępnej recenzji wewnętrznej (warunkiem dopuszczenia tekstu do dalszych czynności recenzyjnych jest jego zgodność z profilem czasopisma). Po pozytywnym zaopiniowaniu przez redaktora naczelnego artykuł jest przekazywany do dwóch niezależnych recenzentów tematycznych spoza jednostki, którzy oświadczają, iż nie zachodzi konflikt interesów pomiędzy nimi a autorami (za konflikt interesów uznaje się zachodzące między recenzentem a autorem: bezpośrednie relacje osobiste (pokrewieństwo, związki prawne, konflikt), relacje podległości zawodowej, bezpośrednia współpraca naukowa w ciągu ostatnich dwóch lat poprzedzających przygotowanie recenzji).
Recenzent wypełnia pisemnie ustalony przez Redakcję formularz recenzji (link poniżej) i przedstawia jednoznaczny wniosek odnośnie do dopuszczenia artykułu do publikacji lub jego odrzucenia.
Autor jest informowany o wyniku dokonanej recenzji, następnie możliwa jest korespondencja z Redakcją czasopisma dotycząca ewentualnych uwag bądź kwalifikacji do druku. Ostateczną kwalifikację do druku podejmuje redaktor naczelny. Redakcja zastrzega sobie możliwość odesłania artykułu autorowi do ponownego przeredagowania w przypadku recenzji negatywnej.
Do druku przyjmowane są jedynie te artykuły, które otrzymały pozytywne recenzje dwóch recenzentów. W przypadku uzyskania jednej recenzji pozytywnej i jednej recenzji negatywnej powoływany jest przez redaktora naczelnego trzeci recenzent (superrecenzent). W zależności od wyniku trzeciej recenzji (pozytywna lub negatywna) artykuł jest przyjmowany do publikacji lub odrzucany przez redaktora naczelnego.
W procesie recenzji stosowany jest system double-blind review, tj. zarówno recenzenci nie znają tożsamości autorów, jak i autorzy nie znają tożsamości recenzentów.
Nazwiska recenzentów współpracujących ze „Studiami Mazowieckimi” są zamieszczone na stronie internetowej czasopisma.
Teksty przeznaczone do publikacji poddawane są sprawdzeniu antyplagiatowemu za pomocą usługi Similarity Check dostarczanej przez Crossref i opartej na oprogramowaniu do porównywania tekstu iThenticate.